近日，由中南大學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究中心鄔玲仟教授和梁德生教授課題組牽頭、貝瑞基因提供技術(shù)支持的三代測序地中海貧血基因檢測技術(shù)多中心產(chǎn)前診斷臨床研究成果，發(fā)表于檢驗醫(yī)學(xué)權(quán)威國際期刊CLINICALCHEMISTRY(影響因子12.167)。

針對這一分子遺傳學(xué)重要成果，CLINICALCHEMISTRY專門發(fā)表編輯部評論文章并給予高度評價，彰顯了三代測序技術(shù)為復(fù)雜單基因病的分子診斷帶來的全新機遇，以及在臨床應(yīng)用上的巨大價值及廣闊前景。

資深專家高度評價：產(chǎn)前診斷應(yīng)用場景優(yōu)勢明顯

該多中心臨床研究主要針對地中海貧血(簡稱“地貧”)。由于目前尚無有效治療中間型或重型地貧的方法，產(chǎn)前診斷成為預(yù)防此類出生缺陷的有效手段。

以α、β-地貧為典型代表的復(fù)雜單基因病，在胎兒期不具備完整的可觀測的臨床表型，故分子檢測結(jié)果的精準(zhǔn)性以及極高的陽性預(yù)測值(PPV)對于產(chǎn)前診斷的決策至關(guān)重要。加上地貧基因的高度同源性及變異的復(fù)雜多樣性，傳統(tǒng)PCR方法和短讀長的二代測序(NGS)方法并不是檢測的最佳方法。

此次研究分別基于傳統(tǒng)PCR和CATSA ( ComprehensiveAnalysisofThalassemiaAleles)方法對來自11個研究中心的278例高危妊娠羊膜穿刺術(shù)樣本進行了雙盲背靠背研究。PCR檢測出191個胎兒攜帶地貧變異基因，CATSA準(zhǔn)確地識別出206個胎兒攜帶地貧變異基因。結(jié)果不一致樣本進一步采用Sanger測序等技術(shù)驗證，最終證實CATSA檢測結(jié)果準(zhǔn)確性為100%。與PCR方法學(xué)相比，CATSA方法陽性檢出率顯著提高(7.9%，15/191)，其中PCR方法在檢測范圍內(nèi)出現(xiàn)4例假陰/假陽性結(jié)果。另外，CATSA方法還在11例樣本中多檢出有臨床意義的地貧基因變異。值得注意的是，CATSA檢測結(jié)果修正了8個胎兒的表型預(yù)測結(jié)果，其中一個胎兒因為傳統(tǒng)PCR方法誤診 (PCR方法提示為HBBc.52A>T純合變異，CATSA方法結(jié)果為HBBc.52A>T雜合變異)導(dǎo)致被錯誤終止妊娠的遺憾結(jié)局。

來自麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)布羅德學(xué)院的兩位資深專家KatherineA.Laf-ferty和DianaM.Toledo同期撰文對該項臨床研究予以高度評價。

基于三代測序的創(chuàng)新性基因診斷方法相較于常規(guī)基于PCR方法，有效提高了地貧基因檢測的靈敏度、特異性、PPV和NPV，是臨床應(yīng)用效能的重大進步。基于CATSA方法在地貧產(chǎn)前診斷應(yīng)用場景中的明顯優(yōu)勢，地貧產(chǎn)前診斷分子檢測應(yīng)提倡采用CASTA方法聯(lián)合檢測解決方案，以便于得到一個完整準(zhǔn)確的結(jié)果。因為當(dāng)一個家庭面對自己的妊娠做出決定的時刻，假陽性或假陰性結(jié)果會造成極大的不良后果。

三代測序先發(fā)布局

得益于高保真、長讀長的三代測序技術(shù)，8%的人類基因組復(fù)雜區(qū)域終被攻克。2022年4月，被譽為生命科學(xué)“登月計劃”的人類基因組測序也迎來了完整無間隙的序列，為整個基因行業(yè)打開了一扇全新的大門。

而貝瑞基因在三代測序領(lǐng)域的布局也早已開啟，遵循科研先行、硬件提速、產(chǎn)品落地的原則，為打造三代測序篩查“中國方案”進行不懈探索。截至2022年底，貝瑞基因累計服務(wù)三代測序檢測樣本量突破10萬人份，服務(wù)終端客戶超過1500家。

開展多項重磅臨床研究的同時，貝瑞基因在三代測序儀上實現(xiàn)自主可控，擁有雄厚儲備。在此基礎(chǔ)上，公司落地了三代地貧、三代CAH(先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥)、三代SMA(脊髓性肌萎縮癥)、三代FXS(脆性X綜合征)等產(chǎn)品，并均取得發(fā)明專利證書。

值得一提的是，貝瑞基因福州數(shù)字生命產(chǎn)業(yè)園已完成三代測序應(yīng)用轉(zhuǎn)化中心建設(shè)。以此為載體，貝瑞基因?qū)⑾蚋鄰?fù)雜基因變異疾病發(fā)起挑戰(zhàn)，力求在單基因全病種的檢測上做到精準(zhǔn)“一鍵解決”。

亓萱